ISO14001は環境マネジメントシステムの認証に用いる基準を規定した規格です。一方、ISO9001は品質マネジメントシステムの認証に用いる基準を規定した規格です。両方とも組織の経営運営に関わる仕組みや活動に関して規定しています。しかし、ISO9001の方は製品やサービスの品質保証のための規格であるので個別の要求事項の実現に関する規定などが加えられ品質の安定が求められています。また、ISO9001は本来第二者監査と呼ばれる「買手が売手をチェックすること」を第三者の審査機関が行えるように審査基準を共通化して規格にしたものですが、ISO14001は第二者監査の肩代りというよりは不特定多数の利害関係者に代わっての監査のようになっています。